PESQUISA VETERINÁRIA BRASILEIRA

Abstract in English:

Clostridioides difficile is a strictly anaerobic, spore-forming Gram-positive bacterium associated with diarrhea, known as C. difficile infection (CDI). In domestic animals, C. difficile is considered an important pathogen mostly in pigs and horses, but there are also reports in other domestic species. In wild animals, the epidemiology of C. difficile is largely unknown, and the role of the bacterium as a cause of diarrhea is unclear. The aim of this study was to determine the prevalence of C. difficile in the feces of wild animals referred to the Center of Medicine and Research in Wild Animals (CEMPAS). Fecal samples obtained from 100 animals of 34 different species were subjected to qPCR for the detection of the C. difficile 16S rRNA gene and two major toxin genes (tcdA and tcdB) and to anaerobic bacterial isolation. A total of 63 animals (63%) were positive for C. difficile by qPCR, and 16 isolates were recovered. The opossum (Didelphis spp.) had the highest number of positive animals in both tests (from 21 samples, 19 were qPCR positive, and four isolates were recovered). Three toxigenic strains (RT 002, 004, and 014), all previously described as infecting humans and animals, were isolated in the following species: bearded dragon (Pogona vitticeps), pampas fox (Lycalopex vetulus), and marmoset (Callithrix sp.). The presence of C. difficile in the feces of wild animals highlights the importance of wildlife as potential carriers of infection for production animals or humans.

• Didelphis spp. qPCR tcdB tcdA wild animals Clostridioides difficile

Abstract in Portuguese:

O Clostridioides difficile é uma bactéria Gram-positiva estritamente anaeróbica e formadora de esporos, associada à diarreia e conhecida como infecção por C. difficile (CID). Em animais domésticos, o C. difficile é considerado um patógeno importante principalmente em porcos e cavalos, mas também há relatos em outras espécies domésticas. Em animais selvagens, a epidemiologia do C. difficile é amplamente desconhecida, e o papel da bactéria como causa de diarreia não está claro. O objetivo deste estudo foi determinar a prevalência do C. difficile nas fezes de animais selvagens encaminhados ao Centro de Medicina e Pesquisa em Animais Selvagens (CEMPAS). Amostras de fezes obtidas de 100 animais de 34 espécies diferentes foram submetidas à qPCR para a detecção do gene 16S rRNA do C. difficile e dois principais genes de toxina (tcdA e tcdB), além de isolamento bacteriano anaeróbico. Um total de 63 animais (63%) foram positivos para C. difficile por qPCR, e 16 isolados foram recuperados. O gambá (Didelphis spp.) apresentou o maior número de animais positivos em ambos os testes (de 21 amostras, 19 foram positivas na qPCR, e quatro isolados foram recuperados). Três cepas toxigênicas (RT 002, 004 e 014), todas previamente descritas como infectando humanos e animais, foram isoladas nas seguintes espécies: dragão barbado (Pogona vitticeps), raposa-pampas (Lycalopex vetulus) e sagui (Callithrix sp.). A presença de C. difficile nas fezes de animais selvagens destaca a importância da vida selvagem como potencial portadora de infecção para animais de produção ou seres humanos.

• Didelphis spp. qPCR tcdB tcdA animais selvagens Clostridioides difficile

Abstract in English:

A variety of laboratory techniques are used in parasitological diagnosis. However, studies that analyze their laboratory efficiency are very scarce, especially with regard to biological samples from wild animals that are little known, with little popular attachment, such as artiodactyls. These can be infected by different parasites, including protozoa of the phylum Ciliophora, which includes the parasites Balantioides coli and Buxtonella sulcata. In this light, the aim of this study was to compare the efficiency of five coproparasitological techniques for diagnosing protozoan cysts of the phylum Ciliophora in the feces of free-living artiodactyls. To this end, 101 fecal samples were collected from trails in Pedra Selada State Park, Rio de Janeiro state, from 2020 to 2021. All the samples were analyzed using the qualitative techniques of modified Sheather floatation, modified Ritchie sedimentation and Lutz, as well as the quantitative techniques of Mini-FLOTAC and McMaster. Cyst recovery was best achieved using the modified Ritchie technique, in which 62.5% positivity was detected, followed by Lutz (47.5%), modified Sheather (37.5%) and the quantitative techniques of Mini-FLOTAC (30%) and McMaster (17.5%). In most of the comparisons between the techniques, reasonable agreement regarding the diagnosis was observed (Kappa 0.21 to 0.40), which was statistically significant (p≤0.05). McMaster showed higher mean and standard deviation values for counts of cysts per gram of feces than Mini-FLOTAC. However, there was no significant difference in the estimates for cyst counts (Wilcoxon p>0.05). Sedimentation qualitative techniques were more indicated for diagnosing cysts of protozoa of the phylum Ciliophora in the feces of free-living wild artiodactyls. These techniques can therefore be used as laboratory tools for environmental parasite monitoring. In addition, between the two quantitative techniques, Mini-FLOTAC presented better performance, thus showing its potential as a tool for estimating the abundance of cystic forms of the phylum Ciliophora in environmental samples.

• Parasitological diagnosis cyst phylum Ciliophora wild animals

Abstract in Portuguese:

Diversas são as técnicas laboratoriais utilizadas no diagnóstico parasitológico. No entanto, estudos que analisam a eficiência laboratorial das mesmas são muito escassos, principalmente quando se trata de amostras biológicas de animais silvestres, que possuem pouca divulgação e apego popular, como os artiodáctilos. Estes podem se infectar por diferentes parasitos, incluindo os protozoários do Filo Ciliophora, no qual se inclui Balantioides coli, bem como Buxtonella sulcata. Mediante o exposto, este estudo objetivou comparar a eficiência entre cinco técnicas coproparasitológicas para o diagnóstico de cistos de protozoário do Filo Ciliophora em fezes de artiodáctilos em vida livre. Entre 2020 e 2021 foram coletadas 101 amostras fecais em trilhas do Parque Estadual da Pedra Selada localizado no estado do Rio de Janeiro. Todas as amostras foram analisadas pelas técnicas qualitativas de flutuação de Sheather modificada, sedimentação de Ritchie modificada e Lutz, bem como por meio das técnicas quantitativas de Mini-FLOTAC e McMaster. Pode-se verificar uma superioridade na recuperação dos cistos por meio da técnica de Ritchie modificada, no qual foi detectado 62,5% de positividade, seguida pelo Lutz (47,5%), Sheather modificada (37,5%) e pelas técnicas quantitativas de Mini-FLOTAC (30%) e McMaster (17,5%). Na maioria das comparações entre as técnicas foi possível verificar uma concordância razoável (Kappa 0,21 a 0,40) em relação ao diagnóstico entre as mesmas, sendo este estatisticamente significativo (p≤0,05). McMaster em comparação com o Mini-FLOTAC foi a que apresentou os maiores valores médio e de desvio padrão na contagem dos cistos por grama de fezes. No entanto, não foi evidenciado diferença significativa na estimativa de contagem dos cistos (Wilcoxon=p>0,05). Pode-se verificar que as técnicas qualitativas de sedimentação foram consideradas as mais indicadas para o diagnóstico de cistos do protozoário do Filo Ciliophora em fezes de artiodáctilos silvestres em vida livre, podendo ser utilizadas como ferramentas laboratoriais de monitoramento parasitário ambiental. Além disso, dentre as técnicas quantitativas, o Mini-FLOTAC foi a que apresentou a melhor performance, denotando o seu potencial como uma ferramenta para se estimar a abundância de formas císticas do Filo Ciliophora em amostra ambiental.

• Diagnóstico parasitológico cisto filo Ciliophora animais silvestres

Abstract in English:

The present study investigated Salmonella spp. in the feces of 200 foals up to one year of age (100 with clinical signs of diarrhea and 100 without clinical signs of diarrhea). Bacteriological culture, serotyping, antimicrobial susceptibility, and real-time PCR (qPCR SYBR® Green or a TaqMan®) for detecting the invA gene (with and without a selective pre-enrichment step in tetrathionate broth) were performed. Bacterial culture revealed 15% (n=30) of positive animals (21 animals with diarrhea and nine without diarrhea). Among the 30 isolates, 13 different serovars were identified: S. Infantis, S. Minnesota, S. I.4,5,12:i:-; S. Anatum, S. Cerro, S. Oranienburg, S. Braenderup, S. Give, S. Newport, S. IIIb 61:c:z35, S. 109:-:1.5, S. I.4.12:d:-, S. I.6.8:-:-. Multidrug resistance was found in 43.33% (n=13) of the isolates, with one isolate obtained from animals without diarrhea and 12 isolates from animals with diarrhea. All qPCR techniques used in the study classified more samples as positive for Salmonella spp. than the bacterial culture of feces. In addition, all qPCR techniques detected more positive animals in the diarrhea group than in the diarrhea-free group. The results confirm the utility of the qPCR method without the pre-enrichment step in tetrathionate as a rapid test for Salmonella spp. in carrier animals. In animals with clinical signs of diarrhea, it can be combined with bacterial culture (antimicrobial susceptibility testing and serotyping). The isolation of Salmonella spp. in nine animals without diarrhea confirms the importance of asymptomatic carrier animals in the epidemiology of the disease. The multidrug resistance observed highlights the importance of rational antimicrobial use in horses and adopting biosecurity protocols that are efficacious in controlling the spread of infections between animals and zoonotic transmission in farms.

• Horses faeces invA gene multidrug resistance serovars Salmonella spp

Abstract in Portuguese:

O presente estudo investigou a ocorrência de Salmonella spp. em fezes de 200 potros com até um ano de idade (100 com sinais clínicos de diarreia e 100 sem sinais clínicos de diarreia), utilizando as técnicas de cultivo bacteriológico e PCR em tempo real (qPCR) pelos métodos de corante fluorescente (SYBR® Green) e sonda específica (Taqman®) para a detecção do gene invA com e sem etapa de pré-enriquecimento seletivo em caldo de tetrationato. O cultivo bacteriológico revelou 15% (n=30) de animais positivos (21 animais com diarreia e nove animais sem diarreia). Dentre esses 30 isolados, 13 sorovares diferentes foram identificados: S. Infantis, S. Minnesota, S. I.4,5,12:i:-; S. Anatum, S. Cerro, S. Oranienburg, S. Braenderup, S. Give, S. Newport, S. IIIb 61:c:z35, S. 109:-:1.5, S. I.4.12:d:-, S. I.6.8:-:-. Multirresistência foi constatada em 43,33% (n=13) dos isolados, sendo um isolado obtido de animal sem diarreia e 12 isolados de animais com diarreia. Todas as técnicas de qPCR empregadas no estudo apresentaram maior número de amostras classificadas como positivas para Salmonella spp. comparadas ao cultivo bacteriológico de fezes. Adicionalmente, em todas as técnicas de qPCR houve maior número de animais detectados como positivos no grupo de animais com diarreia em relação aos animais sem diarreia. Os resultados confirmaram a utilidade do método qPCR sem a etapa de pré-enriquecimento em tetrationato, como um teste rápido para detecção de Salmonella spp. em animais portadores ou em animais com sinais clínicos de diarreia. O cultivo bacteriológico deve ser associado para a realização do teste de sensibilidade aos antimicrobianos e sorotipificação. O isolamento de Salmonella spp. em nove animais sem diarreia, confirma a importância dos animais portadores assintomáticos na epidemiologia da doença. A multirresistência observada evidencia a importância do uso racional de antimicrobianos em equinos e a importância da adoção de protocolos de biossegurança que sejam eficazes para controlar a disseminação de infecções entre animais e a transmissão zoonótica nas fazendas.

• Equinos fezes gene invA multirresistência sorovares Salmonella spp

Abstract in English:

Molecular detection of Eimeria species in fecal samples can be useful for experimental and diagnostic purposes. However, the parasite quantity presence in feces and the oocyst wall are an obstacle in DNA extraction protocols. Therefore, adequate sampling and effective disruption of the oocysts are essential to improve the accuracy of DNA detection by PCR. The aims of this study were to evaluate the suitability of six protocols for DNA extraction from Eimeria spp. present in bovine and sheep. Twenty pools of fecal samples from cattle (10 pools) and sheep (10 pools) were distributed to six DNA extraction protocols: commercial kit, commercial kit with modification, DNAzol, cetyl-trimethyl ammonium bromide (CTAB), glass beads and commercial kit for fecal samples. Fecal samples were submitted to DNA extraction and PCR. Among the protocols tested, CTAB was determined to be most suitable for DNA extraction from oocysts (90% of DNA detection by PCR); DNAzol and CTAB resulted in higher DNA detection from bovine samples (80%). CTAB and commercial kit with modification improved PCR detection of Eimeria spp. in sheep samples, with positive amplification of DNA in all tested samples.

• DNA extraction molecular detection Eimeria spp. cattle sheep PCR fecal samples

Abstract in Portuguese:

A detecção molecular de espécies de Eimeria em amostras fecais pode ser útil para fins experimentais e de diagnóstico. No entanto, a quantidade de parasitas nas fezes e a parede do oocisto são um obstáculo nos protocolos de extração de DNA. Portanto, uma amostragem adequada e a ruptura efetiva dos oocistos são essenciais para melhorar a precisão da detecção de DNA por PCR. Os objetivos deste estudo foram avaliar seis protocolos para extração de DNA de Eimeria spp. em amostras de bovinos e ovinos. Foram distribuídos 20 grupos de amostras fecais de bovinos (10 grupos) e ovinos (10 grupos) em seis protocolos de extração de DNA: kit comercial, kit comercial com modificação, DNAzol, brometo de cetil-trimetil amônio (CTAB), pérolas de vidro e kit comercial para amostras fecais. As amostras fecais foram submetidas à extração de DNA e PCR. Entre os protocolos testados, CTAB foi considerado o mais adequado para extração de DNA de oocistos (90% de detecção de DNA por PCR); DNAzol e CTAB resultaram em maior detecção de DNA em amostras de bovinos (80%). CTAB e kit comercial com modificação melhoraram a detecção por PCR de Eimeria spp. em amostras de ovinos, amplificação positiva de DNA em todas as amostras testadas.

• Extração de DNA detecção molecular Eimeria bovinos ovinos DNA PCR amostras fecais

Abstract in English:

ABSTRACT.- Batista A.M.B., Da Costa Pereira M.A.V., Vita G.F., Barbosa C.G., Silva Antonio I.M., Barros S.C.W., Magalhães A.R. & Freitas J.P. 2012. [Qualitative survey of parasites genera on fecal samples of alligators in a commercial closed farming system in the state of Rio de Janeiro.] Levantamento qualitativo de gêneros de parasitos em amostras fecais de jacarés criados comercialmente em sistema fechado no estado do Rio de Janeiro. Pesquisa Veterinária Brasileira 32(10):1045-1049. Setor de Parasitologia, Hospital Veterinário, Laboratório de Sanidade Animal, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, Av. Alberto Lamego 2000, Campos dos Goytacazes, RJ 28013-602, Brazil. E-mail: angelicadacostapereira@yahoo.com.br The objective of this paper was to diagnose qualitatively parasite genera found in environmental fecal samples of alligators (Caiman latirostris Daudin, 1802) commercially bred from 2008 to 2009 in a closed farming system in the state of Rio de Janeiro. A total of 300 samples were collected from 150 young, 80 fattening and 70 breeding processed by two different methods, the flotation (method of Willis-Mollay) and simple sedimentation (method of Lutz), according to Hoffmann (1987). The samples were then examined by optical microscopy. The results revealed presence of Eimeria and Isospora oocysts, Balantidium cysts, and Acanthostomum and Dujardinascaris eggs.

• Caiman sp.

Abstract in Portuguese:

RESUMO.- Batista A.M.B., Da Costa Pereira M.A.V., Vita G.F., Barbosa C.G., Silva Antonio I.M., Barros S.C.W., Magalhães A.R. & Freitas J.P. 2012. [Qualitative survey of parasites genera on fecal samples of alligators in a commercial closed farming system in the state of Rio de Janeiro.] Levantamento qualitativo de gêneros de parasitos em amostras fecais de jacarés criados comercialmente em sistema fechado no estado do Rio de Janeiro. Pesquisa Veterinária Brasileira 32(10):1045-1049. Setor de Parasitologia, Hospital Veterinário, Laboratório de Sanidade Animal, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, Av. Alberto Lamego 2000, Campos dos Goytacazes, RJ 28013-602, Brazil. E-mail: angelicadacostapereira@yahoo.com.br O objetivo desta pesquisa foi realizar um diagnóstico qualitativo dos gêneros de parasitos encontrados em amostras fecais ambientais de jacarés (Caiman latirostris Daudin, 1802), criados comercialmente em sistema fechado, no período de 2008 a 2009, no estado do Rio de Janeiro. Um total de 300 amostras foi coletado de 150 filhotes, 80 de animais de engorda e 70 de reprodução, e submetido a análises coproparasitológicas, de flutuação (método de Willis-Mollay) e sedimentação simples (método de Lutz), de acordo com Hoffmann (1987). As amostras foram visualizadas à luz da microscopia óptica. Os resultados obtidos evidenciaram a presença de oocistos de Eimeria e Isospora, cistos de Balantidium e ovos de Acanthostomum e Dujardinascaris.